คณะวิศวกรรมศาสตร์ ได้รับความไว้วางใจจากกรมประมงให้เป็นที่ปรึกษาโครงการ Sea Food Bank จัดทำแผนที่ฐานและระบบสารสนเทศพื้นที่เพาะเลี้ยงสัตว์น้ำ ซึ่งเป็นโครงการของรัฐบาลในการนำพื้นที่เพาะเลี้ยงสัตว์น้ำชายฝั่งที่มีศักยภาพมาจัดสรรให้แก่ประชาชน และเพื่อให้โครงการนี้เป็นไปด้วยความรวดเร็วและถูกต้องตามหลักวิชาการ กรมประมงจึงได้ว่าจ้างให้คณะวิศวกรรมศาสตร์เป็นที่ปรึกษาโครงการดังกล่าว เพื่อจัดทำแผนที่ฐาน สำหรับใช้ในการพิจารณาแบ่งแปลงพื้นที่อนุญาตเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำในพื้นที่ 284,000 ไร่ ใน 22 จังหวัดชายทะเล รวมถึงการพัฒนาโปรแกรมประยุกต์เพื่อให้บริการข้อมูลด้วยระบบสารสนเทศภูมิศาสตร์บนอินเตอร์เน็ท (Web-based GIS) ในวงเงินว่าจ้าง 15 ล้านบาท โดยได้ดำเนินการมาตั้งแต่เดือนสิงหาคม 2548 และแล้วเสร็จในช่วงปลายเดือนมีนาคมที่ผ่านมา และก่อนที่จะส่งมอบงานให้กรมประมง คณะฯ ได้จัดฝึกอบรมให้ความรู้ในการใช้โปรแกรมประยุกต์แก่เจ้าหน้าที่กรมประมงจากส่วนกลางและส่วนภูมิภาค จำนวน 61 คน ขึ้นเมื่อวันที่ 9 มีนาคม 2549 ณ ห้องปฎิบัติการคอมพิวเตอร์ อาคารวิศวกรรมศาสตร์ 60 ปี